까마귀쪽나무 열매가 유방암 세포의 유전자 발현에 미치는 영향

Abstract

이번 연구는 차세대 염기서열분석 NGS 의 유전자 분석법을 활용해 다량의 유전자 발현을 살펴보고 세포에 영향을 미치는 유전자를 선별했다. 유전자 분석을 통해 얻은 데이터의 실제 생물학적 의미를 확인하기 위해 릿지 자포니카 과일은 농도 특이 실험에서 얻은 데이터를 대조군과 비교해 세포사망, 세포주기, 세포 이력 내 유전자의 증감을 조사했다. 유전자 온톨로지 분석, 산점도, 군집화를 실시했고, 이때 발현도가 2배 이상 높거나 낮게 발현된 유전자 상위 유의: 접이식 변화 f2 가 발현 증감이 있는 유의 유전자로 선정됐다. 유전자 온톨로지 분석은 전체 유전자 2만5737개 중 세포자살 927개, 세포자살 1208개, 세포자살 1000개 등 3개 항목으로 결과를 분석해 유전자 칩별 유전자 발현 횟수 및 비율을 파악했다. 유전자 발현 분포를 나타내는 그래프로 각 유전자 간 발현 유사도를 나타내기 위해 클러스터링을 수행했다. 주요 단어: Litsea japonica fruit, 차세대 염기서열 분석, 유전자 데이터 분석, 암세포, 세포자살, 세포주기, 세포사망.|This study used the gene analysis method of next generation sequencing NGS to look at large amounts of gene expression and select genes that affect cells. To confirm the actual biological meaning of data obtained through genetic analysis, Litsea japonica fruit the data obtained from the concentration-specific experiments were compared with the control group to investigate the cell death, cell cycle, and the increase and decrease of genes in cell history. Gene ontology analysis, scatter plot, and clustering were performed, and at this time, the gene expressed more than twice as high or lower in expression up significant: fold change f2 was selected as a significant gene with increased and reduced expression. Gene ontology analysis analyzed the results with 3 items: 927 apoptosis, 1,208 apoptosis, and 1,000 apoptosis out of 25,737 genes, and identified the number and ratio of gene expressions, gene names, expression volume, and pathways for each gene chip. As a graph representing the distribution of gene expression, clustering was performed to indicate the degree of similarity of expression between each gene.